JR東日本によると、6月3日午前7時前、地震の影響で、JR信越線が新潟県の直江津（上越市）－塚山（長岡市）間、JR飯山線が戸狩野沢温泉（長野県）－越後川口（新潟県長岡市）間のいずれも上下線で運転を見合わせた。JR飯山線は3日午前7時半までに運転を再開。JR信越線は3日午前11時までに運転を再開した。
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新潟日報 2024年6月3日 7時25分
JR東日本によると、6月3日午前7時前、地震の影響で、JR信越線が新潟県の直江津（上越市）－塚山（長岡市）間、JR飯山線が戸狩野沢温泉（長野県）－越後川口（新潟県長岡市）間のいずれも上下線で運転を見合わせた。JR飯山線は3日午前7時半までに運転を再開。JR信越線は3日午前11時までに運転を再開した。
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