PayPayでは、2024年10月以降、東京大学や早稲田大学など計9校の国立大学法人と学校法人への寄付の支払いに対応した。
研究や教育など、国立大学法人や学校法人が公開している各分野の活動に対して、自分で寄付したい活動を選び、PayPayで寄付できる。利用できる残高はPayPayマネーのみ。
2024年10月31日から東京大学、11月18日より広島大学、立教大学で寄付受け付けを開始し、12月初旬に早稲田大学、12月中旬に関東学院大学、東北大学、明治大学、12月中に千葉大学と北海道大学で寄付受け付けを開始する。
寄付金額に対してPayPayポイントの付与やPayPayステップは対象外。