ヒトの大部分の遺伝子多型を検出するプライマー/プローブ配列をカタログ化
PR TIMES / 2014年9月22日 14時30分
株式会社ダナフォームは、理化学研究所と共同で既知のヒト遺伝子多型(SNP等)の大部分(約4000万箇所)を検出するプライマー・プローブセットを全て設計し、新サービスとしてWebサイトに公開しました。
公開Webサイト http://www.dnaform.com/snp_assay_list/
研究者は公開された設計情報によって容易に遺伝子多型の解析研究を進めることができます。
プライマー・プローブセットの一部であるEprobe(R)は同社の蛍光オリゴ合成サービスより購入できます。
株式会社ダナフォーム(社長:三谷康正)と理化学研究所(理事長:野依良治)は、共同開発したDNA検出法「PEM(PCR Eprobe Melting)法」を使い、ヒトの既知の遺伝子多型約6,000万箇所を検出するためのプライマーと蛍光プローブ(Eprobe(R))の最適な配列を全て計算し、世界最大規模となる約4,000万箇所に対するプライマーと蛍光プローブの配列をカタログ化しました。これにより、研究者はプライマー/プローブ配列の検討をすることなく、容易に遺伝子多型の解析研究を進めることができます。
一塩基多型(SNP)などの遺伝子多型に基づく個別化医療は、遺伝情報を活用した医療サービスの中で最も期待されている分野です。蛍光プローブEprobe(R)は従来のプローブよりも結合安定性が高く、配列を短くできるため、これまで設計の難しかった遺伝子多型が密集した領域に対して、設計が容易になりました。また、塩基の違いによる結合安定性の差がわずかな遺伝子多型に対しても、設計が容易になりました。
PEM法には遺伝子多型を検出するためのプライマーと蛍光プローブEprobe(R)のセットが必要です。そこで共同研究グループは、PEM法に最適化した設計ソフトウェア「Edesign」を使って各遺伝子多型を検出するためのプライマーおよびEprobe(R)の最適な配列を計算し、セットを選出しました。
今回のカタログ化により研究が効率化するため、遺伝子多型に基づく個別化医療に向け研究の加速が期待できます。プライマー・プローブセットの一部であるEprobe(R)は、ダナフォーム社の蛍光オリゴ合成サービスより購入できます。
カタログ化した約4,000万箇所のプライマーとプローブのセットの配列情報は、設計ソフトウェアのEdesignと併せて、ダナフォーム社のウェブサイトにて無償で公開しています。
・SNPアッセイカタログ(http://www.dnaform.com/snp_assay_list/)
・Edesign(http://www.dnaform.com/edesign/)
企業プレスリリース詳細へ
PRTIMESトップへ
この記事に関連するニュース
-
国内初!「カスタマイズが自在」オリジナル遺伝子検査パッケージのOEMの受託・開発を提供開始 クライアントニーズに合った200以上のSNPからの自由な組み合わせが可能
PR TIMES / 2024年7月12日 17時40分
-
芽生えの段階でのリンゴ果実特性の予測精度が向上!~ゲノム情報の統合で過去に取得したデータも利用可能に~
PR TIMES / 2024年7月8日 15時45分
-
世界初、中性子線照射による藻類の品種改良技術を確立
PR TIMES / 2024年7月4日 17時45分
-
世界初、中性子線照射による藻類の品種改良技術を確立 ~バイオ燃料原料の油脂生成量を最大1.3倍に増加させることに成功~
Digital PR Platform / 2024年7月4日 15時10分
-
アレルギー疾患に関連するゲノム領域の重要性を解明~気管支ぜんそくの新規治療法の開発に期待~
PR TIMES / 2024年6月27日 10時45分
ランキング
-
1投資信託「以外」のほったらかし投資の選択肢とは 年利10%ならおよそ「7年で資産が倍」になる
東洋経済オンライン / 2024年7月21日 9時0分
-
2コメが品薄、価格が高騰 米穀店や飲食店直撃「ここまでとは」
産経ニュース / 2024年7月21日 17時41分
-
3サーティワン、大幅増益 「よくばりフェス」や出店増が奏功
ITmedia ビジネスオンライン / 2024年7月19日 18時48分
-
4ウィンドウズ障害、便乗したフィッシング詐欺のリスク高まる…復旧名目に偽メール・偽ホームページ
読売新聞 / 2024年7月22日 0時0分
-
5物言う投資家エリオット、スタバ株を大量取得=関係筋
ロイター / 2024年7月20日 5時59分
記事ミッション中・・・
記事にリアクションする
記事ミッション中・・・
記事にリアクションする
エラーが発生しました
ページを再読み込みして
ください