かつては世間から悪しきことと見られる風潮もあった不登校。近年、不登校に対する認知度や理解が高まりつつある背景には、『不登校新聞』の存在があると言っても過言ではない。創刊以来一貫して当事者目線での報道を徹底し、子どもや親などへ「学校以外の居場所や相談できる場所があること」を伝え続けている。
本紙の発起人らは、親の会やフリースクールを設立し、登校拒否・不登校を考える全国ネットワークを結成するなどの活動を十数年にわたり続ける中で、不登校を発信する自分たちのメディアがほしいと感じるようになったという。活動の起点は、学校復帰を迫られる苦しい状況を変えるためで、マスコミの取材に対する違和感もあった。
具体的に歩みを進めたきっかけは、1997年に起きた長期休み明けの子どもの自殺や学校の放火などの複数のショッキングな事件だ。学校以外に逃げ場があることが知られていない、と強い危機感を持ち、1998年5月1日に数名で不登校新聞を創刊させた。プロとしての編集経験を持つ者は誰もいなかった。