【学習院大学】カイコガ科の野生種イチジクカサンの高精度ゲノムアノテーション情報を公開

ポイント　
●イチジクカサン(Trilocha varians)はカイコと同じカイコガ科に属する小型蛾類です。本研究では、イチジクカサンのゲノム情報を整備しました。
●研究に用いたイチジクカサン系統は、ゲノムの99.9%以上が個体間で一致しており、高度の純系化した系統であるということがわかりました。
●イチジクカサンのゲノムでは、カイコでは第11染色体上に存在する、核小体形成領域（NOR）が第20染色体上にあることが判明しました。
●実験動物としてのイチジクカサンの利用を促進するため、ゲノムデータに生物学的な注釈をつけました（アノテーション情報整備）。
●アノテーション情報を利用することで同じカイコガ科のカイコとの生理的・生態的相違を生み出す遺伝子基盤を明らかにすることが期待されます。






■研究の概要　
学習院大学理学部生命科学科の李允求助教、同嶋田透教授、岩手大学の藤本章晃特別助教(現所属：九州大学)、同佐原健教授、基礎生物学研究所の山口勝士主任技術員、同重信秀治教授らの研究グループは、2024年6月に同グループが発表したイチジクカサンの染色体スケールのゲノムアセンブリに対して、生物学的な注釈づけを行いました。このイチジクカサン系統は、2010年に石垣島（沖縄県石垣市）で捕獲された個体から樹立した系統であり、およそ百数十世代の長期累代による近交系です。この系統のゲノムを解析したところ、高度に純系化が進んでいることが判明し、さらにカイコでは第11染色体上に存在する核小体形成領域（NOR）が、イチジクカサンでは第20染色体上に存在することが明らかになりました。また、遺伝子モデルの構築やゲノム編集ツールの適用を見据えたオープンクロマチンアッセイ※1など、イチジクカサンゲノムのアノテーション情報を整備しました。



本研究成果は、2025年1月21日に国際学術誌「Scientific Data」に掲載されました。

■研究の背景

イチジクカサンは、ガジュマルの害虫として知られており、日本では2001年に初めて、沖縄県に生息していることが報告されました。イチジクカサンは、カイコと同様にカイコガ科の昆虫であるにもかかわらず、食性、休眠性、性フェロモンの組成など様々な点でカイコとは性質が異なります。そのため、イチジクカサンはカイコガ科の進化を研究する上で格好の材料といえます。また、世代間隔が1ヶ月弱であり、その点においてはモデル生物であるカイコ（世代間隔は2ヶ月弱）よりも実験動物として優れています。モデル生物としてのイチジクカサンの利用促進のために、ゲノム情報の整備が望まれていました。