【名古屋大学】日本人の自閉スペクトラム症患者の遺伝的背景を探索 ～国内初の全ゲノム解析結果を活用し、病態ベースの診断へ～

名古屋大学の大学院医学系研究科の古川 佐和子 博士課程学生、医学部附属病院　ゲノム医療センターの久島　周 病院講師、大学院医学系研究科の池田 匡志 教授、尾崎 紀夫 特任教授、環境医学研究所の荻 朋男 教授らの研究グループは、日本人の自閉スペクトラム症（ASD）（注1）トリオ家系（注2）に対して全ゲノムシーケンス解析（注3）を実施し、一塩基バリアントから構造バリアント（注4）、短鎖リピート配列（注5）、ミトコンドリアバリアント、そしてポリジェニックリスクスコア（注6）まで、幅広い種類のバリアントを探索しました。その結果31.6％の患者に病的バリアントの候補を検出しました。
知的発達症を併存するASD患者では、43.5%で病的バリアントの候補が検出されました。特に、3名のASD患者には、PTEN、CHD7、HNRNPH2遺伝子上にde novoの病的バリアントが検出され、遺伝カウンセリングの対象となりました。患者に検出された、タンパク質に影響を及ぼしうるバリアントの遺伝子オントロジー解析（注7）では、バリアントがある遺伝子は「成長の制御」と「ATP依存性クロマチンリモデリング活性（注8）」に集積し、これらが病態に関係していると考えられました。
本研究成果は、2024年11月29日付国際科学雑誌『Psychiatry and Clinical Neurosciences』に掲載されました。




【本研究のポイント】
・自閉スペクトラム症（ASD）は、遺伝的背景および表現型が多様な神経発達症であり、その発症には遺伝要因が強く関与する。
・本研究では、日本人（名大病院およびその関連病院）の自閉スペクトラム症患者57人と両親で、病的コピー数バリアント（注9）（CNV）が検出されていない群を対象に全ゲノムシーケンス解析を実施し、様々なバリアントを包括的に探索・評価した。
・その結果、31.6%の患者に既知のASD関連遺伝子上の病的バリアントの候補が検出され、知的発達症を伴う群では43.5%であった。
・検出されたバリアントのうち、タンパク質機能に影響をおよぼしうるバリアントがある遺伝子は、「成長の制御」と「ATP依存性クロマチンリモデリング活性」に集積し、これらが病態に関係していると考えられた。
・症状からASDと診断されているケースから、病態に基づく診断につながり、ASDに関するより確かなエビデンスを患者に還元することが期待される。