Fixstars Solutions、共著論文が米サイエンス誌に掲載
PR TIMES / 2021年2月8日 14時15分
6ヶ月かかる研究データ分析を5日に短縮し、研究に貢献
マルチコアCPU/GPU/FPGAを用いた高速化技術のグローバルリーダーである株式会社フィックスターズ(東証1部: 3687、代表取締役社長 CEO:三木 聡)の米国子会社Fixstars Solutions, Inc.(本社:米カリフォルニア州アーバイン、CEO:村瀬正名)は、世界的に権威のある科学雑誌のサイエンス誌に共著論文が掲載されたことをお知らせします。論文は、米国時間1月29日から公開されています。
この論文は、遺伝子の塩基配列を調べる「シーケンシング」の新手法である「Expansion Sequencing (ExSeq)」とその研究成果を報告しています。ExSeqは生体内(in situ)リボ核酸(RNA)シーケンシングの一種で、塩基配列と同時にRNAが細胞内にどのように分布しているか分かります。論文では、比較的安価な光学顕微鏡で高解像度にRNAの分布を明らかにしました。
Fixstars Solutionsのソフトウェア高速化技術と高速ストレージを組み合わせることにより、10TBのデータ当たり6カ月かかるExSeqの分析を5日に短縮しました。
共著者であるFixstars Solutions ソフトウェアエンジニアリング担当マネージャの梶田 睦は、次のように述べています。
「膨張顕微鏡法(expansion microscopy)を用いたin situ RNAシーケンシングは、生体内で『どんなRNAがどこに分布しているのか』という、配列情報と位置情報を同時に知るための、画期的な手法の一つです。各研究機関・企業の方々の功績が認められ、論文が採択されたことを、心よりお喜び申し上げます。また、微力ながら本研究に関われたことはFixstars Solutionsにとっても重要な成果です。引き続き貢献できるよう努力してまいります」
フィックスターズとFixstars Solutionsは、今後もソフトウェアの高速化サービスを通じてライフサイエンス分野の発展に貢献してまいります。
論文名
Expansion Sequencing: Spatially Precise In Situ Transcriptomics in Intact Biological Systems
(https://science.sciencemag.org/content/371/6528/eaax2656)
著者(Fixstars Solutions所属者のみ抜粋)
Atsushi Kajita (梶田 睦 Fixstars Solutions ソフトウェアエンジニアリング担当マネージャ)
Karl Marrett(ソフトウェアエンジニア)
Robert Prior(ソフトウェアエンジニア)
論文要旨
Methods for highly multiplexed RNA imaging are limited in spatial resolution and thus in their ability to localize transcripts to nanoscale and subcellular compartments. We adapt expansion microscopy, which physically expands biological specimens, for long-read untargeted and targeted in situ RNA sequencing. We applied untargeted expansion sequencing (ExSeq) to the mouse brain, which yielded the readout of thousands of genes, including splice variants. Targeted ExSeq yielded nanoscale-resolution maps of RNAs throughout dendrites and spines in the neurons of the mouse hippocampus, revealing patterns across multiple cell types, layer-specific cell types across the mouse visual cortex, and the organization and position-dependent states of tumor and immune cells in a human metastatic breast cancer biopsy. Thus, ExSeq enables highly multiplexed mapping of RNAs from nanoscale to system scale.
フィックスターズについて
フィックスターズ(https://www.fixstars.com/ja/)は、”Speed up your Business” をコーポレートメッセージとして掲げるソフトウェアカンパニーです。 マルチコアプロセッサを効率的に利用するためのソフトウェアの並列化および最適化と、省電力かつ高速IOを実現する新メモリ技術を活用したアプリケーションの高速化を通じて、医療、製造、金融、エンターテインメントなど、様々な分野のお客様のビジネスを加速し、グリーンITを実現しています。
企業プレスリリース詳細へ
PR TIMESトップへ
この記事に関連するニュース
-
フィックスターズ、生成AI/LLM技術で、日本経済のさらなる成長に向けて、株式会社レトリバ社との資本業務提携締結のお知らせ
PR TIMES / 2024年4月24日 12時45分
-
レトリバ、生成AI/LLM技術で、日本経済のさらなる成長に向けて、株式会社フィックスターズとの資本業務提携締結のお知らせ
PR TIMES / 2024年4月24日 12時15分
-
量子コンピューティングクラウドサービス「Fixstars Amplify」、 「NEC Vector Annealing サービス」を標準マシンに追加して提供開始
PR TIMES / 2024年4月16日 14時15分
-
【龍谷大学】ジュゴンがまだ琉球列島に生息している科学的証拠を公表
Digital PR Platform / 2024年4月9日 14時5分
-
フィックスターズのAI開発技術を活かした「生成AI/LLM向けGPUのコスト削減診断サービス」を提供開始
PR TIMES / 2024年3月30日 18時45分
ランキング
-
1【解説】円安どこまで進む? 深刻…家計にも影響、為替介入の可能性は
日テレNEWS NNN / 2024年4月25日 20時5分
-
2なぜ歯磨き粉はミント味? ヒット商品の誕生には「無駄」が必要なワケ
ITmedia ビジネスオンライン / 2024年4月26日 8時0分
-
3英郵便局の冤罪事件、会計システム原因の富士通社長「申し訳ない」と謝罪…1月にドラマ化され批判強まる
読売新聞 / 2024年4月25日 23時0分
-
4濃口醤油と淡口醤油、塩分が高いのはどっち?…醤油の「色の濃さ」と「味の濃さ」の知られざる関係
プレジデントオンライン / 2024年4月26日 8時15分
-
5突然現場に現れて「良案」を言い出す上司の弊害 「気になったら即座に直したい」欲求への抗い方
東洋経済オンライン / 2024年4月26日 8時0分
記事ミッション中・・・
記事にリアクションする
記事ミッション中・・・
記事にリアクションする
エラーが発生しました
ページを再読み込みして
ください